1911年4月27日（即三二九之役），广州的起义，是革命党又一次大团结，宋也自上海南下参加。不幸功败垂成，黄兴等痛心牺牲太大，极想改弦更张，幸宋及时于是年7月31日在上海组成中部同盟会，得以把握由四川保路运动而掀起的怒潮。同年10月10日武昌新军起义，先期曾邀请宋及黄兴莅鄂领导。10月28日，宋黄赶到武昌，迅速看出必须各省响应才能掌握主动。因之，宋在商讨若干军政问题后，立即赶回长江下游，调和江浙联军意见，光复南京。这不仅消弭了汉阳被清军攻占的危机，并且奠定了大革命胜利成功的基础，从此，宋就注全力于组织临时政府的工作。
是年圣诞日，孙逸仙先生自海外归来，经过张继的斡旋，宋捐弃前嫌由南京赴上海欢迎，但始终坚持责任内阁制的主张。适章炳麟又公开倡言宋是内阁总理的最佳人选，因之引起许多人对宋的误会，以致孙就任临时大总统时原拟提名宋任内务总长的计划也被迫取消，只有委屈宋担任法制局长。
面对这一局势，宋毫不气馁，并且更坚定他的一贯立场。在孙决定将总统职位让予袁世凯时，宋复倡言推有责任内阁制可以限制袁的野心。民国元年（1912年）3月，临时参议院制定中华民国临时约法中就大体采纳了宋的意见。唐绍仪经袁提名出任国务总理时，宋也被选任农林总长，这自然是用非所长；但为着尝试责任内阁制，宋仍欣然北上就职。
民国元年5月，这一新内阁正式展开工作，但不过一月余，唐绍仪就因不能忍受袁蔑视临时约法而告退，宋也连带辞职。宋因此体认到：当时只有翻雨覆云的政客供袁利用，而没有立场鲜明坚定的政党相互制衡，是这一新制尝试中挫的主要原因；故决心不顾一切，重提他在南京拟议将同盟会改组为政党的主张。章士钊也在《民立报》扬言「毁党造党」响应宋的主张。是年8月，宋的主张终于实现了，同盟会结合其它四个政团组成国民党。
由于孔子认为「君子不党」，汉唐宋的朋党之祸又深入中国人心；因此中国知识分子讳言组党，甚至在民国成立前后，一般政治性的组织也宁愿使用「会」或「社」字而避免使用「党」字。如今宋的行动如此，充份表现他勇于一反过去传统以及热心推行西方政制于中国，可以说，这是中国迈向近代化的又一里程碑。
民国元年8月25日，国民党成立大会在北京举行，孙逸仙亲临参加，并当选为理事长，宋当选为理事，在孙离开北京时代理事长。顾维钧、张东荪、徐傅霖等都被推为各部干事，戴季陶、胡汉民等也有公开的言论和行动拥护宋草拟的党纲。但民国14年以后，戴胡又反唇讥评宋将同盟会改组为国民党是「革命党第一罪人」。可是现存直接文献显示：这只是戴胡本身思想前后有变化，而不是宋当时的行动有错误。
为着和国民党对峙，几个小政团也合并为共和党，后来梁启超也拟加入共和党；因之，自表面说，两大政党对峙的局势，总算有其雏形了。当时双方都集全力于争取第一届国会议员的选举，若干欧美竞选活动方式也被仿行，尤以宋在长江流域各省都市演说，一方面宣扬本党的政纲，一方面指责执政者在内政外交上的种种错误，以争取选民同情。这在外国是司空见惯，在中国却是空前创举，招致袁世凯的嫉恨是可以想象的。当时曾有人劝告宋小心，但宋以为要开新风气，非如此不可，仍旧不顾一切照常活动。民国2年1月大选结果揭晓，国民党大胜，在国会中获得大多数席位，这证明大多数国民不喜欢袁的专制行为。因之国人纷纷揣测：宋是国民党实际的领袖，自将由国会推选为国务总理，而谁将被选为大总统呢？国民党以及若干独立性报纸已暗示袁不是唯一人选，章炳麟等则主张推黎元洪以代袁，宋也同意，因为以黎个性及背景，推行内阁制较易。但黎知袁野心，忙着通电谦让，因此更使袁迫不及待非去此眼中钉──宋教仁不可，乃一面假意殷勤，约宋北上商谈国会事宜；一面派人伺机暗杀宋。民国2年3月20日，宋在上海车站乘车北上时，袁所嗾使的凶手就把握机会：二枪中宋腹部，以致回生乏术，于22日逝世。这就是中华民国历史上有名的「宋案」，从此开启「二次革命」及国民党打倒军阀运动的序幕。
宋教仁的死，举国哀悼，孙逸仙先生急自日本赶回上海，哀挽宋是为中华民国宪法而牺牲的第一人。宋的著述，多散见《20世纪之支那》、《民报》、《民立报》等，民国2年4月民立报社会曾辑印其中一部份，此外并没有全集。其日记「我之历史」及徐血儿等编辑其遗文之「宋渔父」已列入拙编《中国近代史料丛书》中影印行世。相湘另撰有「宋教仁──中国民主宪政的先驱」一册，传记文学社出版。（來源：《湖南文献》季刊 2013年第一期）